MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 37088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018631	AGA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598990
2	NC_018631	TA	3	6	88	93	50 %	50 %	0 %	0 %	406598990
3	NC_018631	ATT	2	6	130	135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598990
4	NC_018631	TGA	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598990
5	NC_018631	AGC	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598990
6	NC_018631	TCA	2	6	236	241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598990
7	NC_018631	TGT	2	6	354	359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598990
8	NC_018631	ATTTA	2	10	434	443	40 %	60 %	0 %	0 %	406598990
9	NC_018631	GGT	2	6	445	450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598990
10	NC_018631	ACA	2	6	505	510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598990
11	NC_018631	CAG	2	6	536	541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598990
12	NC_018631	T	6	6	546	551	0 %	100 %	0 %	0 %	406598990
13	NC_018631	TGT	2	6	629	634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598990
14	NC_018631	TGAT	2	8	635	642	25 %	50 %	25 %	0 %	406598990
15	NC_018631	TCTGG	2	10	653	662	0 %	40 %	40 %	20 %	406598990
16	NC_018631	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598990
17	NC_018631	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598990
18	NC_018631	ATC	2	6	727	732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598990
19	NC_018631	TTG	2	6	761	766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598990
20	NC_018631	TAA	2	6	987	992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598990
21	NC_018631	A	6	6	1016	1021	100 %	0 %	0 %	0 %	406598990
22	NC_018631	ATCA	2	8	1039	1046	50 %	25 %	0 %	25 %	406598990
23	NC_018631	ACT	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598990
24	NC_018631	TGA	2	6	1110	1115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598990
25	NC_018631	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	406598990
26	NC_018631	TGG	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598990
27	NC_018631	TCAT	2	8	1236	1243	25 %	50 %	0 %	25 %	406598990
28	NC_018631	A	6	6	1332	1337	100 %	0 %	0 %	0 %	406598990
29	NC_018631	ATG	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598991
30	NC_018631	TC	3	6	1586	1591	0 %	50 %	0 %	50 %	406598991
31	NC_018631	ACA	2	6	1609	1614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598991
32	NC_018631	AAG	2	6	1652	1657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598991
33	NC_018631	AATT	2	8	1730	1737	50 %	50 %	0 %	0 %	406598991
34	NC_018631	AAC	2	6	1742	1747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598991
35	NC_018631	CTG	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598991
36	NC_018631	GAT	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598991
37	NC_018631	GCA	2	6	1945	1950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598991
38	NC_018631	TTG	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598991
39	NC_018631	ATT	2	6	1963	1968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598991
40	NC_018631	CAAA	2	8	1972	1979	75 %	0 %	0 %	25 %	406598991
41	NC_018631	AG	3	6	1998	2003	50 %	0 %	50 %	0 %	406598991
42	NC_018631	AGC	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598991
43	NC_018631	TAC	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598991
44	NC_018631	GTT	2	6	2259	2264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598991
45	NC_018631	TTA	2	6	2341	2346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598991
46	NC_018631	AAG	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598991
47	NC_018631	AAG	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598991
48	NC_018631	GAT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598991
49	NC_018631	TCACAC	2	12	2845	2856	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	406598992
50	NC_018631	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598992
51	NC_018631	ATT	2	6	2877	2882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598992
52	NC_018631	TCT	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598992
53	NC_018631	GGT	2	6	2889	2894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598992
54	NC_018631	A	6	6	2961	2966	100 %	0 %	0 %	0 %	406598992
55	NC_018631	TA	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	406598992
56	NC_018631	TCATT	2	10	3010	3019	20 %	60 %	0 %	20 %	406598992
57	NC_018631	TGA	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598992
58	NC_018631	GCA	3	9	3045	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598992
59	NC_018631	AAG	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598992
60	NC_018631	TGC	4	12	3074	3085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598992
61	NC_018631	A	8	8	3086	3093	100 %	0 %	0 %	0 %	406598992
62	NC_018631	GCT	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598992
63	NC_018631	GGT	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598992
64	NC_018631	GGT	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598992
65	NC_018631	GTG	2	6	3226	3231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598992
66	NC_018631	T	7	7	3333	3339	0 %	100 %	0 %	0 %	406598993
67	NC_018631	AGT	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598993
68	NC_018631	AAG	2	6	3450	3455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598993
69	NC_018631	A	6	6	3527	3532	100 %	0 %	0 %	0 %	406598993
70	NC_018631	AT	3	6	3571	3576	50 %	50 %	0 %	0 %	406598993
71	NC_018631	TTATT	2	10	3591	3600	20 %	80 %	0 %	0 %	406598993
72	NC_018631	CGG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406598993
73	NC_018631	TACAA	2	10	3695	3704	60 %	20 %	0 %	20 %	406598993
74	NC_018631	AAAC	2	8	3761	3768	75 %	0 %	0 %	25 %	406598993
75	NC_018631	T	7	7	3780	3786	0 %	100 %	0 %	0 %	406598993
76	NC_018631	TGC	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598993
77	NC_018631	A	7	7	3997	4003	100 %	0 %	0 %	0 %	406598993
78	NC_018631	CAA	2	6	4004	4009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598993
79	NC_018631	GAT	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598993
80	NC_018631	TAATGA	2	12	4075	4086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406598993
81	NC_018631	CAA	2	6	4112	4117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598993
82	NC_018631	CAA	2	6	4163	4168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598993
83	NC_018631	GAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598993
84	NC_018631	AATT	2	8	4311	4318	50 %	50 %	0 %	0 %	406598993
85	NC_018631	CAA	2	6	4343	4348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598993
86	NC_018631	AGA	2	6	4363	4368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598993
87	NC_018631	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598994
88	NC_018631	ATAA	2	8	4419	4426	75 %	25 %	0 %	0 %	406598994
89	NC_018631	TGA	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
90	NC_018631	CAAG	2	8	4476	4483	50 %	0 %	25 %	25 %	406598994
91	NC_018631	GTAT	2	8	4567	4574	25 %	50 %	25 %	0 %	406598994
92	NC_018631	ACT	2	6	4584	4589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598994
93	NC_018631	TTG	2	6	4621	4626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598994
94	NC_018631	TGA	2	6	4637	4642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
95	NC_018631	TGA	2	6	4709	4714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
96	NC_018631	TGG	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598994
97	NC_018631	TGG	3	9	4805	4813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598994
98	NC_018631	TATAT	2	10	4912	4921	40 %	60 %	0 %	0 %	406598994
99	NC_018631	AT	3	6	5020	5025	50 %	50 %	0 %	0 %	406598994
100	NC_018631	ACA	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598994
101	NC_018631	AG	3	6	5144	5149	50 %	0 %	50 %	0 %	406598994
102	NC_018631	GAA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598994
103	NC_018631	AGC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598994
104	NC_018631	GGT	2	6	5337	5342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598994
105	NC_018631	ATCA	2	8	5474	5481	50 %	25 %	0 %	25 %	406598994
106	NC_018631	GGCA	2	8	5542	5549	25 %	0 %	50 %	25 %	406598994
107	NC_018631	ATG	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
108	NC_018631	TTG	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598994
109	NC_018631	GCT	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598994
110	NC_018631	GTT	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598994
111	NC_018631	CA	3	6	5822	5827	50 %	0 %	0 %	50 %	406598994
112	NC_018631	GAA	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598994
113	NC_018631	TGA	2	6	5942	5947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
114	NC_018631	TTA	2	6	5980	5985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598994
115	NC_018631	ACC	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598994
116	NC_018631	TGA	2	6	6152	6157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
117	NC_018631	ACA	2	6	6258	6263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598994
118	NC_018631	TCG	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598994
119	NC_018631	TGA	2	6	6347	6352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
120	NC_018631	CAC	2	6	6358	6363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598994
121	NC_018631	GAA	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598994
122	NC_018631	A	6	6	6520	6525	100 %	0 %	0 %	0 %	406598995
123	NC_018631	CAT	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598995
124	NC_018631	TCG	2	6	6662	6667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598995
125	NC_018631	TTG	2	6	6733	6738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598995
126	NC_018631	ATC	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598995
127	NC_018631	TTG	2	6	6832	6837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598995
128	NC_018631	TGC	3	9	6875	6883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598995
129	NC_018631	ATG	2	6	6973	6978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
130	NC_018631	GAA	2	6	6981	6986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598995
131	NC_018631	GTTA	2	8	7025	7032	25 %	50 %	25 %	0 %	406598995
132	NC_018631	CAA	2	6	7063	7068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598995
133	NC_018631	TGA	2	6	7117	7122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
134	NC_018631	CAAA	2	8	7275	7282	75 %	0 %	0 %	25 %	406598995
135	NC_018631	ATT	2	6	7299	7304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598995
136	NC_018631	TGA	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
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258	NC_018631	ATT	2	6	12257	12262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406599000
259	NC_018631	TGA	2	6	12315	12320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406599000
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262	NC_018631	CTA	2	6	12423	12428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406599001
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393	NC_018631	TGT	3	9	19482	19490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406599008
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397	NC_018631	T	6	6	19746	19751	0 %	100 %	0 %	0 %	406599008
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400	NC_018631	GTTGCT	2	12	20062	20073	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	406599008
401	NC_018631	GA	3	6	20077	20082	50 %	0 %	50 %	0 %	406599008
402	NC_018631	ATGG	2	8	20103	20110	25 %	25 %	50 %	0 %	406599008
403	NC_018631	CATCA	2	10	20124	20133	40 %	20 %	0 %	40 %	406599008
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407	NC_018631	CAT	2	6	20315	20320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406599008
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434	NC_018631	AAT	2	6	21361	21366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406599010
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